Tom Nooks Laden ist einer wichtigsten Orte in deiner Stadt. Dort verkauft Tom Nook eine sich täglich ändernde Auswahl an Items und kauft dir Items für ein Viertel von dem Preis ab, für die er sie ohne Rabatte verkauft. Tom Nook hat auch einen Katalog, in dem du die meisten Items bestellen kannst, die du bereits in den Taschen hattest. Die bestellten Items werden dir dann per Post geschickt.

Tom Nook handelt genauso wie Sigrid mit Rüben, wobei Sigrid dir die Rüben an einem Sonntag verkauft und Tom Nook an jedem Tag (außer am Sonntag) Rüben von dir kaufen kann. Tom Nook ändert seine Ankaufspreise für Rüben alle zwölf Stunden.

Am Anfang des Spiels kannst du dir ein Haus aussuchen, das Tom Nook gehört (das ist der einzige Zeitpunkt, zu dem du Tom Nook außerhalb seines Ladens siehst). Anschließend musst du den Kredit für das Haus abbezahlen und für kurze Zeit als Aushilfe in Tom Nooks Laden arbeiten. Diese Zeit dient als eine Art Tutorial und bringt dir die Grundlagen des Spiels (wie zum Beispiel Sternis verdienen) bei.

Im Laufe des Spiels wird Tom Nook seinen Laden ausbauen, wenn du eine bestimmte Mindestanzahl an Sternis ausgegeben hast und die jeweilige vorherige Ladenstufe bereits mindestens eine bestimmte Tagesanzahl geöffnet war. Die verschiedenen Ausbaustufen des Ladens bestimmen die Öffnungszeiten und die Auswahl der Items im Laden. Im Gegensatz zu vorherigen Spielen kann MegaNook auch zu HyperNook ausgebaut werden, wenn kein Spieler aus einer anderen Stadt etwas in Nooks Laden in deiner Stadt kauft. Im HyperNook arbeiten Nepp und Schlepp im Obergeschoss.

Nach dem ersten Ausbau zu HyperNook wird Tom Nook dich gelegentlich nach deinen Wünschen über den Laden fragen, wodurch Tom Nook die Ladenstufe ändern kann. Du kannst wählen, was dir an Tom Nooks Laden am wichtigsten ist: eine „Große Auswahl“ (HyperNook), der „Mittelweg“ (MegaNook) oder die „Öffnungszeiten“ (SuperNook). Wählst du „Eigentlich egal“, bleibt die Ladenstufe so wie sie ist. Bei jedem Umbau wird der Laden für einen Tag geschlossen.

Jeder Ausbau von Nooks Laden hat seine eigene Hintergrundmusik, die außer in den letzten zehn Minuten der Öffnungszeit die ganze Zeit spielt. In den letzten zehn Minuten spielt eine langsame und sanfte Version der Stadttor-Musik.

Wenn du in Nooks Laden Items kaufst, bekommst du Punkte, welche du für Prämien im Nintendo-Stil tauschen kann. Je nachdem wie viele Punkte du hast, hast du einen bestimmten Mitgliederstatus. Wenn der Mitgliederstatus entsprechend hoch ist, bekommst du Rabatte und ein Modell von Nooks Laden.

Es gibt vier verschiedene Mitgliederstatus:

Bild	Name	Mitgliederstatus	Punkte	Rabatt
	Laden-Modell Nook's Cranny	Bronze	300	-
	SuperNook-Modell Nook 'n' Go	Silber	5.000	5%
	MegaNook-Modell Nookway	Gold	10.000	10%
	HyperNook-Modell Nookington's	Platin	20.000	20%

Deinen Punktestand kannst du an der Bonuspunktemaschine im Laden einsehen. Für 100 ausgegebene Sternis in Nooks Laden (einschließlich dem Katalog) bekommst du einen Punkt. Zusätzlich kannst du dir einmal am Tag „Besucherpunkte“ an der Bonuspunktemaschine holen. In deiner eigenen Stadt bekommst du pro Tag drei Punkte, während du beim Besuch einer anderen Stadt fünf Punkte bekommst.

Findet eine Punkteaktion in Nooks Laden statt, bekommst du an diesem Tag für jeden Einkauf fünfmal so viele Punkte wie normalerweise. Die Punkteaktion wird drei Tage vorher am schwarzen Brett angekündigt.

Folgende Prämien kannst du an der Bonuspunktemaschine eintauschen:

Bild	Name	Punkte
	Banane banana	500 Punkte
	Rotpanzer-Set triple shells	800 Punkte
	Yoshi-Ei Yoshi's egg	1.000 Punkte
	Wario-Schnauzer bad bro stache	2.500 Punkte
	Toad-Mütze Toad hat	3.000 Punkte
	Peach-Schirm Peach's parasol	4.000 Punkte
	Varia-Outfit Varia suit	5.000 Punkte
	Heldenmantel hero's clothes	5.000 Punkte
	Wario-Mütze Wario hat	5.000 Punkte
	Heldenhut hero's cap	6.000 Punkte
	Majoras Maske Majora's mask	6.000 Punkte
	Samusmaske Samus mask	6.000 Punkte
	Midnamaske Midna's Mask	6.500 Punkte
	Kart kart	10.000 Punkte

Manchmal gibt es bei Tom Nook einen Ausverkauf, bei dem alles nur 50 % des normalen Preises kostet. Dieser Ausverkauf wird am Tag, an dem er stattfindet, am schwarzen Brett angekündigt. Die 50 % gelten nur für Waren, die gerade im Laden sind, und nicht für den Katalog. Diese Rabatte gelten auch nicht für Silber-, Gold- oder Platinmitglieder.

Ab und zu kannst du Sonderangebote kaufen. Bei Sonderangeboten handelt es sich um Möbelstücke, die nur selten zu Verkauf stehen, aber im Katalog nachbestellbar sind, wenn du sie einmal gekauft hast beziehungsweise einmal in deinen Taschen hattest. Sonderangebote werden am selben Tag am schwarzen Brett angekündigt und erscheinen nicht so oft wie der Ausverkauf.